Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SEMA3CQ99985 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms