Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PTPN18Q99952 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PTPN18Q99952 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms