Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POP1Q99575 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POP1Q99575 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
POP1Q99575 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
POP1Q99575 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
POP1Q99575 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms