Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
VAT1Q99536 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
VAT1Q99536 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms