Protein–RNA interactions for Protein: Q96SM3

CPXM1, Probable carboxypeptidase X1, humanhuman

Predictions only

Length 734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPXM1Q96SM3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CPXM1Q96SM3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CPXM1Q96SM3 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms