Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CITED4Q96RK1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CITED4Q96RK1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms