Protein–RNA interactions for Protein: Q96NT0

CCDC115, Coiled-coil domain-containing protein 115, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC115Q96NT0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CCDC115Q96NT0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CCDC115Q96NT0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms