Protein–RNA interactions for Protein: Q96NL0

RUNDC3B, RUN domain-containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNDC3BQ96NL0 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
RUNDC3BQ96NL0 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
RUNDC3BQ96NL0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms