Protein–RNA interactions for Protein: Q96MF7

NSMCE2, E3 SUMO-protein ligase NSE2, humanhuman

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE2Q96MF7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
NSMCE2Q96MF7 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NSMCE2Q96MF7 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms