Protein–RNA interactions for Protein: Q96M89

CCDC138, Coiled-coil domain-containing protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC138Q96M89 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CCDC138Q96M89 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC138Q96M89 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms