Protein–RNA interactions for Protein: Q96M63

CCDC114, Coiled-coil domain-containing protein 114, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC114Q96M63 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC114Q96M63 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms