Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CNBD2Q96M20 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CNBD2Q96M20 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms