Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
LINC00208Q96KT6 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms