Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN9

GJD4, Gap junction delta-4 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD4Q96KN9 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJD4Q96KN9 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
GJD4Q96KN9 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms