Protein–RNA interactions for Protein: Q96KK3

KCNS1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, humanhuman

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS1Q96KK3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
KCNS1Q96KK3 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
KCNS1Q96KK3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms