Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CHAMP1Q96JM3 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CHAMP1Q96JM3 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms