Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
LRIG1Q96JA1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
LRIG1Q96JA1 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms