Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ZBED3Q96IU2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ZBED3Q96IU2 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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