Protein–RNA interactions for Protein: Q96HU1

SGSM3, Small G protein signaling modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM3Q96HU1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SGSM3Q96HU1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SGSM3Q96HU1 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms