Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
CENPNQ96H22 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CENPNQ96H22 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms