Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EDC3Q96F86 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EDC3Q96F86 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms