Protein–RNA interactions for Protein: Q969Z0

TBRG4, Protein TBRG4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG4Q969Z0 ZNF516-202ENST00000532857 482 ntTSL 217.4■□□□□ 0.382e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-211ENST00000435520 878 ntTSL 317.38■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 COX10-204ENST00000581931 1509 ntTSL 217.34■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC19A1-204ENST00000427839 648 ntTSL 317.33■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RSF1-206ENST00000528095 2107 ntTSL 1 (best)17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ECSIT-205ENST00000585898 607 ntTSL 217.31■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DHX38-207ENST00000566329 683 ntTSL 217.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ENTPD6-206ENST00000418890 656 ntTSL 317.3■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-222ENST00000523623 581 ntTSL 317.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SHROOM2-203ENST00000452575 2276 ntTSL 517.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NDUFC1-204ENST00000503453 682 ntTSL 317.22■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NAP1L4-209ENST00000492594 570 ntTSL 317.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.352e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EP400NL-209ENST00000488030 1366 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RALA-203ENST00000436179 882 ntTSL 217.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-208ENST00000517418 977 ntTSL 217.19■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TCEA2-205ENST00000415602 726 ntTSL 317.19■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-228ENST00000525441 610 ntTSL 217.18■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 WDR27-206ENST00000474018 951 ntTSL 217.17■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.342e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-216ENST00000572549 663 ntTSL 517.14■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MECR-208ENST00000473030 919 ntTSL 317.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PEAR1-206ENST00000469390 4470 ntTSL 217.13■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.332e-8■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TMEM164-207ENST00000471255 418 ntTSL 317.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TRAF7-202ENST00000564067 874 ntTSL 317.11■□□□□ 0.332e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 METTL22-216ENST00000568967 1672 ntTSL 217.02■□□□□ 0.322e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 UNG-204ENST00000539287 2234 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PAPOLA-203ENST00000553357 585 ntTSL 517.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FLNB-208ENST00000475487 541 ntTSL 217.01■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PDCD4-203ENST00000444997 819 ntTSL 317■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.312e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-223ENST00000512131 615 ntTSL 216.95■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HSPG2-204ENST00000412328 828 ntTSL 216.92■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYO1D-204ENST00000577352 1008 ntTSL 216.91■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.32e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.295e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TINAGL1-209ENST00000481165 4759 ntTSL 216.88■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MGRN1-208ENST00000587747 1898 ntTSL 516.86■□□□□ 0.294e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.295e-12■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 TINAGL1-204ENST00000463112 3075 ntTSL 216.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MYLK-207ENST00000464489 5901 ntTSL 1 (best)16.85■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PSEN2-208ENST00000495488 627 ntTSL 316.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.292e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FPGS-216ENST00000488307 1172 ntTSL 516.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-228ENST00000515737 2579 ntTSL 216.82■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.281e-7■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ATP6V0E2-205ENST00000464683 495 ntTSL 516.8■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DMTN-213ENST00000519850 587 ntTSL 416.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 JUP-208ENST00000449889 1069 ntTSL 316.76■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAP1-204ENST00000469613 1654 ntTSL 1 (best)16.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR2C2-207ENST00000435454 495 ntTSL 316.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DCTN1-215ENST00000458655 565 ntTSL 416.73■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 STX18-AS1-204ENST00000512438 549 ntTSL 316.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RPS6KA2-209ENST00000507371 759 ntTSL 316.72■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.272e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RAB40C-210ENST00000566290 753 ntTSL 316.7■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-209ENST00000571756 1890 ntTSL 216.68■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 KMT5B-208ENST00000434573 585 ntTSL 416.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.262e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC7A1-202ENST00000450494 547 ntTSL 216.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 EPHB4-204ENST00000477446 1551 ntTSL 1 (best)16.6■□□□□ 0.252e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 PLLP-202ENST00000564018 449 ntTSL 516.58■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-233ENST00000531660 667 ntTSL 316.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 NR1H3-229ENST00000527464 1183 ntTSL 1 (best)16.56■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CORO7-230ENST00000576437 1066 ntTSL 516.52■□□□□ 0.242e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 ARHGAP11B-203ENST00000563110 2043 ntTSL 1 (best)16.52■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
TBRG4Q969Z0 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.232e-6■■■■■ 54.9
Retrieved 100 of 20,769 protein–RNA pairs in 276.7 ms