Protein–RNA interactions for Protein: Q969V6

MKL1, MKL/myocardin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 931 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKL1Q969V6 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MKL1Q969V6 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MKL1Q969V6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms