Protein–RNA interactions for Protein: Q969G6

RFK, Riboflavin kinase, humanhuman

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFKQ969G6 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RFKQ969G6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RFKQ969G6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms