Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TNPO1Q92973 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms