Protein–RNA interactions for Protein: Q92845

KIFAP3, Kinesin-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFAP3Q92845 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
KIFAP3Q92845 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
KIFAP3Q92845 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms