Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TSC1Q92574 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TSC1Q92574 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms