Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
TOPBP1Q92547 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOPBP1Q92547 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOPBP1Q92547 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms