Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HERVK_113Q902F9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HERVK_113Q902F9 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms