Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF1

PSPC1, Paraspeckle component 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1Q8WXF1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSPC1Q8WXF1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSPC1Q8WXF1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
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