Protein–RNA interactions for Protein: Q8WU68

U2AF1L4, Splicing factor U2AF 26 kDa subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L4Q8WU68 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
U2AF1L4Q8WU68 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U2AF1L4Q8WU68 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms