Protein–RNA interactions for Protein: Q8TAE8

GADD45GIP1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45GIP1Q8TAE8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
GADD45GIP1Q8TAE8 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms