Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHX4

SPATA3, Spermatogenesis-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPATA3Q8NHX4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SPATA3Q8NHX4 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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