Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH1

TTLL11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, humanhuman

Predictions only

Length 800 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTLL11Q8NHH1 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TTLL11Q8NHH1 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TTLL11Q8NHH1 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms