Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEJ9

NGDN, Neuroguidin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGDNQ8NEJ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
NGDNQ8NEJ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
NGDNQ8NEJ9 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms