Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDI1

EHBP1, EH domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHBP1Q8NDI1 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EHBP1Q8NDI1 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EHBP1Q8NDI1 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms