Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND83

SLAIN1, SLAIN motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN1Q8ND83 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
SLAIN1Q8ND83 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
SLAIN1Q8ND83 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms