Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBJ5

COLGALT1, Procollagen galactosyltransferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
COLGALT1Q8NBJ5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
COLGALT1Q8NBJ5 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms