Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNBD1Q8NA66 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CNBD1Q8NA66 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms