Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
LINC00518Q8N0U6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LINC00518Q8N0U6 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms