Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZF0

NALCN, Sodium leak channel non-selective protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NALCNQ8IZF0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
NALCNQ8IZF0 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NALCNQ8IZF0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms