Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
RPAP2Q8IXW5 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPAP2Q8IXW5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms