Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLF2Q8IX21 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SLF2Q8IX21 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms