Protein–RNA interactions for Protein: Q86XW9

NME9, Thioredoxin domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME9Q86XW9 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME9Q86XW9 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NME9Q86XW9 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
NME9Q86XW9 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NME9Q86XW9 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms