Protein–RNA interactions for Protein: Q86W92

PPFIBP1, Liprin-beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP1Q86W92 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
PPFIBP1Q86W92 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PPFIBP1Q86W92 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms