Protein–RNA interactions for Protein: Q86VQ0

LCA5, Lebercilin, humanhuman

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCA5Q86VQ0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
LCA5Q86VQ0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
LCA5Q86VQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms