Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7K0

CMC1, COX assembly mitochondrial protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1Q7Z7K0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CMC1Q7Z7K0 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CMC1Q7Z7K0 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms