Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PTF1AQ7RTS3 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PTF1AQ7RTS3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 156.1 ms