Protein–RNA interactions for Protein: Q709F0

ACAD11, Acyl-CoA dehydrogenase family member 11, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAD11Q709F0 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ACAD11Q709F0 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ACAD11Q709F0 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms