Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZU67

BEND4, BEN domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEND4Q6ZU67 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
BEND4Q6ZU67 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms